genomicInstability

DOI:10.18129 / B9.bioc.genomicInstability

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅genomicInstability。

scRNA-Seq基因组不稳定性估计

Bioconductor版本:3.14

这个包包含运行功能基因组不稳定性分析(GIA) scRNA-Seq数据。GIA估计之间的关联基因表达和基因组编码基因的位置。它使用面积算法量化组相邻基因的浓缩(loci-blocks)基因表达谱和估计每个分析的基因组不稳定性得分(GIS)细胞。

作者:马里亚诺·阿尔瓦雷斯(aut (cre), Pasquale Laise (aut) DarwinHealth (cph)

维修工:马里亚诺·阿尔瓦雷斯< reef103 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“genomicInstability”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“genomicInstability”)

PDF	R脚本	使用genomicInstability
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GeneExpression,SingleCell,软件,SystemsBiology
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.14 (r - 4.1)(< 6个月)
许可证	文件许可证
取决于	R (> = 4.1.0),使彻底失败
进口	mixtools,SummarizedExperiment
链接
建议	SingleCellExperiment,ExperimentHub,pROC
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/DarwinHealth/genomicInstability
BugReports	https://github.com/DarwinHealth/genomicInstability
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	genomicInstability_1.0.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)	genomicInstability_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genomicInstability
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ genomicInstability
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/genomicInstability/
包下载报告	下载数据