geneAttribution

DOI:10.18129 / B9.bioc.geneAttribution

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见geneAttribution

与遗传变异相关的候选基因鉴定

Bioconductor版本:3.14

在人类基因组中一个给定的基因组位点上变异起作用的最有可能的基因或基因的鉴定最基本的功能假设,基因越接近输入位点,该基因就越有可能是致病基因。此外,如果以UCSC . bed文件格式提供,任何将基因组区域与基因联系起来的经验数据(例如eQTL或基因组构象数据)都可以使用。

作者:Arthur Wuster

维护者:Arthur Wuster

引文(从R内,输入引用(“geneAttribution”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

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文档

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browseVignettes(“geneAttribution”)

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文本 新闻

细节

biocViews GenePredictionGenomeWideAssociationGenomicVariation单核苷酸多态性软件VariantAnnotation
版本 1.20.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(5.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于
进口 跑龙套,GenomicRangesorg.Hs.eg.dbBiocGenericsGenomeInfoDbGenomicFeaturesIRangesrtracklayer
链接
建议 TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGeneTxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGeneknitrrmarkdowntestthat
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源包 geneAttribution_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 geneAttribution_1.20.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) geneAttribution_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geneAttribution
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/geneAttribution
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/geneAttribution/
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