geneAttribution

DOI:10.18129 / B9.bioc.geneAttribution

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见geneAttribution．

与遗传变异相关的候选基因鉴定

Bioconductor版本:3.14

在人类基因组中一个给定的基因组位点上变异起作用的最有可能的基因或基因的鉴定最基本的功能假设，基因越接近输入位点，该基因就越有可能是致病基因。此外，如果以UCSC . bed文件格式提供，任何将基因组区域与基因联系起来的经验数据(例如eQTL或基因组构象数据)都可以使用。

作者:Arthur Wuster

维护者:Arthur Wuster

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“geneAttribution”)

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细节

biocViews	GenePrediction，GenomeWideAssociation，GenomicVariation，单核苷酸多态性，软件，VariantAnnotation
版本	1.20.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	跑龙套,GenomicRanges，org.Hs.eg.db，BiocGenerics，GenomeInfoDb，GenomicFeatures，IRanges，rtracklayer
链接
建议	TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	geneAttribution_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	geneAttribution_1.20.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	geneAttribution_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geneAttribution
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/geneAttribution
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/geneAttribution/
软件包下载报告	下载数据