这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅flowcatchR。
Bioconductor版本:3.14
flowcatchR是一组工具来分析体内显微镜成像数据,重点跟踪流动的血液细胞。指导的步骤从分割的计算功能,过滤粒子不感兴趣的,也提供了一套工具来帮助检查执行操作的质量(如分割是多好)。它允许调查的问题跟踪流动细胞如血管,对粒子进行分类在流动,轧制和附着。这个分类是应用研究的现象,比如止血和血栓形成的研究发展。此外,flowcatchR提出了一个集成的工作流解决方案,基于与闪亮的应用集成和Jupyter笔记本,交付和包,可以完全复制bioimage分析R环境。
维护人员:费德里科•马里尼< marinif在uni-mainz.de >
从内部引用(R,回车引用(“flowcatchR”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“flowcatchR”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“flowcatchR”)
HTML | R脚本 | 时间流逝flowcatchR:跟踪和分析细胞显微图像 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | CellBiology,分类,GUI,基础设施,软件,可视化 |
版本 | 1.28.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.0 (r - 3.1)(7.5年) |
许可证 | BSD_3_clause +文件许可证 |
取决于 | R(> = 2.10),方法,EBImage |
进口 | colorRamps,abind,BiocParallel、图表、数据、跑龙套,情节,闪亮的 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | ImageMagick |
增强了 | |
URL | https://github.com/federicomarini/flowcatchRhttps://federicomarini.github.io/flowcatchR/ |
BugReports | https://github.com/federicomarini/flowcatchR/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | flowcatchR_1.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | flowcatchR_1.28.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | flowcatchR_1.28.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowcatchR |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ flowcatchR |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/flowcatchR/ |
包下载报告 | 下载数据 |