flowWorkspace

DOI:10.18129 / B9.bioc.flowWorkspace

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅flowWorkspace。

基础设施代表与封闭的交互和闭塞的血细胞计数数据集。

Bioconductor版本:3.14

这个包是为了方便比较自动控制方法与手工浇注在flowJo完成。这个包让你基本flowJo工作区导入BioConductor和复制flowJo使用flowCore功能的控制。控制层次结构,样品组、补偿和转换,以便执行输出匹配flowJo分析。

作者:迈克格雷格•Finak江

维护人员:格雷格Finak < ozette格雷格。ai >,迈克江<迈克在ozette.ai >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“flowWorkspace”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“flowWorkspace”)

HTML	R脚本	flowWorkspace简介:一个包来存储和maninpulate封闭的流数据
HTML	R脚本	如何合并GatingSets
PDF		参考手册
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文本		安装
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport,DataRepresentation,FlowCytometry,ImmunoOncology,预处理,软件
版本	4.6.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(10.5年)
许可证	文件许可证
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	Biobase,BiocGenerics,cytolib(> = 2.3.9),晶格,latticeExtra,XML,ggplot2,图、图形、grDevices方法、统计stats4,跑龙套,RBGL、工具、Rgraphviz,data.table,dplyr,Rcpp,尺度,matrixStats,RcppParallel,RProtoBufLib,消化,aws.s3,aws.signature,flowCore(> = 2.1.1)ncdfFlow(> = 2.25.4),DelayedArray,S4Vectors
链接	Rcpp,黑洞(> = 1.62.0-1),RProtoBufLib(> = 1.99.4),cytolib(> = 2.3.7),Rhdf5lib,RcppArmadillo,RcppParallel(> = 4.4.2-1)
建议	testthat,flowWorkspaceData(> = 2.23.2),knitr,rmarkdown,ggcyto平行,CytoML,openCyto
SystemRequirements	GNU, c++ 11
增强了
URL
取决于我	ggcyto,highthroughputassays
进口我	CytoML,flowDensity,FlowSOM,flowStats,ImmuneSpaceR,openCyto,PeacoQC
建议我	催化剂,指南针,flowClust,flowCore
我的链接	CytoML
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	flowWorkspace_4.6.0.tar.gz
Windows二进制	flowWorkspace_4.6.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	flowWorkspace_4.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowWorkspace
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ flowWorkspace
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/flowWorkspace/
包下载报告	下载数据