flowCore

DOI:10.18129 / B9.bioc.flowCore

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅flowCore。

flowCore:流式细胞仪的基本结构数据

Bioconductor版本:3.14

提供了S4数据结构和基本功能来处理数据流式细胞术。

作者:B埃利斯(aut),佩里Haaland (aut) Florian Hahne (aut) Nolwenn Le Meur (aut),作者Nishant葛(aut),约瑟夫Spidlen (aut),迈克江(aut (cre),格雷格Finak (aut),撒母耳Granjeaud(施)

维修工:迈克江<迈克在ozette.ai >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“flowCore”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“flowCore”)

PDF	R脚本	流式细胞仪数据的基本功能
HTML		fcs3.html
HTML		hyperlog.notice.html
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays,FlowCytometry,ImmunoOncology,基础设施,软件
版本	2.6.0
Bioconductor自	BioC 2.0 (r - 2.5)(15年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	Biobase,BiocGenerics(> = 0.29.2)grDevices、图形的方法,统计,跑龙套,stats4,Rcpp,matrixStats,cytolib(> = 2.3.4),S4Vectors
链接	Rcpp,RcppArmadillo,黑洞(> = 1.65.0.1),cytolib,RProtoBufLib
建议	Rgraphviz,flowViz,flowStats(> = 3.43.4),testthat,flowWorkspace,flowWorkspaceData,openCyto,knitr,ggcyto,gridExtra
SystemRequirements	GNU, c++ 11
增强了
URL
取决于我	flowBeads,flowBin,flowClean,flowCut,flowFP,flowMatch,flowTime,flowTrans,flowViz,flowVS,ggcyto,HDCytoData,healthyFlowData,highthroughputassays,immunoClust,infinityFlow,ncdfFlow
进口我	催化剂,cmapR,承认,cyanoFilter,cydar,CytoDx,CytoML,CytoTree,ddPCRclust,diffcyt,flowAI,flowBeads,flowCHIC,flowClust,flowDensity,flowMeans,flowMerge,flowPloidy,FlowSOM,flowSpecs,flowStats,flowTrans,flowUtils,flowViz,flowWorkspace,GateFinder,ImmuneSpaceR,MetaCyto,ncdfFlow,oneSENSE,openCyto,PeacoQC,scDataviz,Sconify
建议我	指南针,flowPloidyData
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	flowCore_2.6.0.tar.gz
Windows二进制	flowCore_2.6.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	flowCore_2.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowCore
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ flowCore
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/flowCore/
包下载报告	下载数据