ffpe

DOI:10.18129 / B9.bioc.ffpe

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ffpe。

FFPE芯片表达数据的质量评价和控制

Bioconductor版本:3.14

使用指标识别劣质数据表达数据来源于Formalin-Fixed发达,石蜡包埋(FFPE)数据。还一个函数进行一致性顶部情节(CAT-plots)。

作者:利沃尔德伦

维护人员:利未Waldron < lwaldron。研究在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ffpe”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ffpe”)

PDF	R脚本	ffpe包用户指南
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneExpression,微阵列,质量控制,软件
版本	1.38.0
Bioconductor自	BioC 2.10 (r - 2.15)(10年)
许可证	GPL (> 2)
取决于	R (> = 2.10.0),竞技场队伍、方法
进口	Biobase,BiocGenerics,affy,光民,methylumi,sfsmisc
链接
建议	genefilter,ffpeExampleData
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	benchdamic
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ffpe_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	ffpe_1.38.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	ffpe_1.38.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ffpe
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ffpe
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ffpe/
包下载报告	下载数据