ffpe

DOI:10.18129 / B9.bioc.ffpe

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ffpe

FFPE芯片表达数据的质量评价和控制

Bioconductor版本:3.14

使用指标识别劣质数据表达数据来源于Formalin-Fixed发达,石蜡包埋(FFPE)数据。还一个函数进行一致性顶部情节(CAT-plots)。

作者:利沃尔德伦

维护人员:利未Waldron < lwaldron。研究在gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“ffpe”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ffpe”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ffpe”)

PDF R脚本 ffpe包用户指南
PDF 参考手册

细节

biocViews GeneExpression,微阵列,质量控制,软件
版本 1.38.0
Bioconductor自 BioC 2.10 (r - 2.15)(10年)
许可证 GPL (> 2)
取决于 R (> = 2.10.0),竞技场队伍、方法
进口 Biobase,BiocGenerics,affy,光民,methylumi,sfsmisc
链接
建议 genefilter,ffpeExampleData
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我 benchdamic
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 ffpe_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 ffpe_1.38.0.zip
macOS 10.13(高山脉) ffpe_1.38.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ffpe
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ffpe
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ffpe/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网