fedup

DOI:10.18129 / B9.bioc.fedup

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅fedup

费雪的浓缩和损耗的测试用户定义的路径

Bioconductor版本:3.14

浓缩和损耗的R包测试使用一个确切概率法定义的路径。该方法是专为通用的途径(如注释格式。格林尼治时间,txt xlsx)允许用户自定义注解上运行路径分析。这个包也结合Cytoscape提供基于网络的通路可视化,提高结果的可解释性。

作者:凯瑟琳·罗斯(aut (cre)

维护人员:凯瑟琳·罗斯< catherinem。罗斯在mail.utoronto.ca >

从内部引用(R,回车引用(“fedup”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“fedup”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“fedup”)

HTML R脚本 fedup_doubleTest.html
HTML R脚本 fedup_mutliTest.html
HTML R脚本 fedup_singleTest.html
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews GeneSetEnrichment,网络,NetworkEnrichment,通路,软件
版本 1.2.0
Bioconductor自 BioC 3.13 (r - 4.1)(1年)
许可证 麻省理工学院+文件许可证
取决于 R (> = 4.1)
进口 openxlsx,宠物猫,dplyr,data.table,ggplot2,ggthemes,forcats,RColorBrewer,RCy3跑龙套,统计数据
链接
建议 biomaRt,tidyr,testthat,knitr,rmarkdown,devtools,covr
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/rosscm/fedup
BugReports https://github.com/rosscm/fedup/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 fedup_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 fedup_1.2.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉) fedup_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fedup
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ fedup
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/fedup/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网