fabia。

DOI:10.18129 / B9.bioc.fabia

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅fabia。

Bicluster收购FABIA:因子分析

Bioconductor版本:3.14

Bicluster收购Biclustering“因素分析”(FABIA。)。biclustering FABIA。是一种基于模型的技术,这是集群同时行和列。Biclusters因子分析发现,这两个因素和荷载矩阵是稀疏的。FABIA。是一个乘法模型,提取线性样本之间的依赖关系和功能模式。它捕获现实的非高斯数据分布与沉重的尾巴基因表达的观察测量。FABIA。利用好理解模型选择技术如EM算法和变分方法,嵌入到一个贝叶斯框架。FABIA biclusters排名根据他们的信息内容和分离假biclusters biclusters从如此。代码是用C写的。

作者:然而Hochreiter < hochreit在bioinf.jku.at >

维护人员:Andreas Mitterecker < Mitterecker在bioinf.jku.at >

从内部引用(R,回车引用(“fabia。”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“fabia。”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

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browseVignettes (“fabia。”)

PDF R脚本 FABIA:手册R包
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 聚类,DifferentialExpression,微阵列,MultipleComparison,软件,StatisticalMethod,可视化
版本 2.40.0
Bioconductor自 BioC 2.7 (r - 2.12)(11.5年)
许可证 LGPL (> = 2.1)
取决于 R (> = 3.6.0),Biobase
进口 统计方法、图形grDevices,跑龙套
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL http://www.bioinf.jku.at/software/fabia/fabia.html
取决于我 hapFabia
进口我 miRSM,mosbi
建议我 fabiaData
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 fabia_2.40.0.tar.gz
Windows二进制 fabia_2.40.0.zip
macOS 10.13(高山脉) fabia_2.40.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fabia
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ fabia
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/fabia/
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