eudysbiome

DOI:10.18129 / B9.bioc.eudysbiome

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见eudysbiome

16S微生物资料的笛卡儿图及偶然性检验

Bioconductor版本:3.14

Eudysbiome是一种包,允许根据不同属对宿主疾病的贡献能力(如文献所示)将其注释为有害/无害或基于其模糊的属分类的未知。此外,与参考条件下的微生物组相比,该包统计地测量了给定治疗或环境变化对(肠道,GI)微生物组的正生物(无害属增加或有害属减少)或非生物(无害属减少或有害属增加)的影响。

作者:周晓媛,Christine Nardini

维护者:周晓媛<周晓媛at picb.ac.cn>

引文(从R内,输入引用(“eudysbiome”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“eudysbiome”)

PDF R脚本 eudysbiome用户手册
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 软件
版本 1.24.0
在Bioconductor BioC 3.2 (R-3.2)(6.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.1.0)
进口 plyrRsamtoolsR.utilsBiostrings
链接
建议
SystemRequirements
增强了
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进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 eudysbiome_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 eudysbiome_1.24.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) eudysbiome_1.24.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/eudysbiome
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/eudysbiome
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/eudysbiome/
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