epistack

DOI:10.18129 / B9.bioc.epistack

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅epistack。

从表观遗传信号的热图的堆栈配置文件

Bioconductor版本:3.14

epistack包主要目的是成堆的基因组的可视化跟踪(例如,但不限于,ChIP-seq, ATAC-seq, methyation DNA或基因保护数据)集中在感兴趣的基因组区域。

作者:尚驰萨菲亚(aut) DEVAILLY Guillaume (cre)

维护人员:DEVAILLY Guillaume < gdevailly hotmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“epistack”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“epistack”)

HTML	R脚本	使用epistack
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ChIPSeq,GeneExpression,预处理,RNASeq,软件
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.14 (r - 4.1)(< 6个月)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.1)
进口	GenomicRanges,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,viridisLite、图形、plotrixgrDevices,统计数据
链接
建议	testthat(> = 3.0.0),BiocStyle,knitr,rmarkdown,EnrichedHeatmap,biomaRt,rtracklayer,covr,vdiffr,魔法
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	epistack_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	epistack_1.0.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	epistack_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epistack
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ epistack
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/epistack/
包下载报告	下载数据