此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见epigenomix.
Bioconductor版本:3.14
通过ChIP-seq获得的基于RNA-seq或微阵列的基因转录和组蛋白修饰数据的综合分析包。该软件包提供了数据预处理和匹配的方法,以及贝叶斯混合模型的拟合方法,以检测两种数据类型存在差异的基因。
作者:Hans-Ulrich Klein, Martin Schaefer
维护人员:Hans-Ulrich Klein
引文(从R内,输入引用(“epigenomix”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“epigenomix”)
R脚本 | 表观基因组合包小插图 | |
参考手册 |
biocViews | ChIPSeq,分类,DifferentialExpression,GeneExpression,软件 |
版本 | 1.34.0 |
在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(9年) |
许可证 | LGPL-3 |
取决于 | R(>= 3.2.0),方法,Biobase,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,SummarizedExperiment |
进口 | BiocGenerics,MCMCpack,Rsamtools平行,GenomeInfoDb,beadarray |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | epigenomix_1.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | epigenomix_1.34.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | epigenomix_1.34.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epigenomix |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/epigenomix |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/epigenomix/ |
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