epiNEM

DOI:10.18129 / B9.bioc.epiNEM

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅epiNEM。

epiNEM

Bioconductor版本:3.14

epiNEM是最初的嵌套的延伸效应模型(NEM)。EpiNEM能够考虑淘汰赛和推断出更复杂的网络信号通路的两倍。它是专门针对大型双淘汰赛屏幕。

作者:&马丁Pirkl玛德琳迪克曼

维护人员:马丁Pirkl < martinpirkl在yahoo.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“epiNEM”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“epiNEM”)

HTML	R脚本	epiNEM
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	网络,NetworkInference,通路,软件,SystemsBiology
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.1)
进口	BoolNet,e1071,gtools统计数据,igraph跑龙套,晶格,latticeExtra,RColorBrewer,pcalg,minetgrDevices,图,mnem,latex2exp
链接
建议	knitr,RUnit,BiocGenerics,STRINGdb,devtools,rmarkdown,GOSemSim,AnnotationHub,org.Sc.sgd.db
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/cbg-ethz/epiNEM/
BugReports	https://github.com/cbg-ethz/epiNEM/issues
取决于我
进口我	bnem,dce,nempi
建议我	mnem
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	epiNEM_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	epiNEM_1.18.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	epiNEM_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epiNEM
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ epiNEM
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/epiNEM/
包下载报告	下载数据