diffuStats

DOI:10.18129 / B9.bioc.diffuStats

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅diffuStats

扩散分数生物网络

Bioconductor版本:3.14

品牌传播的方法是一种广泛使用的程序计算生物学给上下文使用网络数据分子实体。节点标签,从基因表达可以推出,全基因组关联研究,蛋白质域或代谢组学分析,在网络传播到他们的邻居,有效地平滑的分数通过之前带注释的小说知识和优先考虑的候选人。R包diffuStats包含一组扩散内核和评分方法,促进了他们的计算,描述和基准测试。

作者:塞吉奥Picart-Armada (aut (cre),亚历山大Perera-Lluna (aut)

维修工:塞尔吉奥Picart-Armada <塞尔吉。在upc.edu picart >

从内部引用(R,回车引用(“diffuStats”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“diffuStats”)

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文档

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browseVignettes (“diffuStats”)

PDF R脚本 案例研究:预测蛋白质功能
HTML R脚本 快速启动
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文本 新闻

细节

biocViews GeneExpression,遗传学,GenomeWideAssociation,GraphAndNetwork,代谢组学,网络,归一化,蛋白质组学,软件,转录组
版本 1.14.0
Bioconductor自 BioC 3.6 (r - 3.4)(4.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 3.4)
进口 grDevices、属性、方法矩阵,质量,使彻底失败,expm,igraph,Rcpp,RcppArmadillo,RcppParallel,plyr,precrec
链接 Rcpp,RcppArmadillo,RcppParallel
建议 testthat,knitr,rmarkdown,ggplot2,ggsci,igraphdata,BiocStyle,reshape2,跑龙套
SystemRequirements GNU使
增强了
URL
取决于我
进口我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 diffuStats_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 diffuStats_1.14.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉) diffuStats_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/diffuStats
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ diffuStats
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/diffuStats/
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