这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅diffcyt。
Bioconductor版本:3.14
统计方法在高维微分分析发现血细胞计数数据(包括流式细胞仪、血细胞计数质量或CyTOF, oligonucleotide-tagged血细胞计数),基于高分辨率的结合集群和经验贝叶斯主持测试改编自转录组。
维护人员:卢卡斯·m·韦伯在gmail.com < lukas.weber.edu >
从内部引用(R,回车引用(“diffcyt”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“diffcyt”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“diffcyt”)
HTML | R脚本 | diffcyt工作流 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | CellBasedAssays,CellBiology,聚类,FeatureExtraction,FlowCytometry,ImmunoOncology,蛋白质组学,SingleCell,软件 |
版本 | 1.14.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(4年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | R (> = 3.4.0) |
进口 | flowCore,FlowSOM,SummarizedExperiment,S4Vectors,limma,刨边机,lme4,multcomp,dplyr,tidyr,reshape2,magrittr、数据、方法、跑龙套,grDevices图形,ComplexHeatmap,circlize、网格 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,HDCytoData,催化剂 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/lmweber/diffcyt |
BugReports | https://github.com/lmweber/diffcyt/issues |
取决于我 | censcyt,cytofWorkflow |
进口我 | CyTOFpower,treekoR |
建议我 | 催化剂 |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | diffcyt_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | diffcyt_1.14.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | diffcyt_1.14.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/diffcyt |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ diffcyt |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/diffcyt/ |
包下载报告 | 下载数据 |