deltaCaptureC

DOI:10.18129 / B9.bioc.deltaCaptureC

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅deltaCaptureC

这个包从3 c数据发现中尺度染色质重塑

Bioconductor版本:3.14

这个包从3 c数据发现中尺度染色质重塑。3 c数据在本质上是局部的。它吉文斯之间的交互项限制性内切酶消化碎片和地区首选的“观点”。通过装箱数据和使用排列测试,这个包可以测试是否有统计学意义的变化之间的交互项数据从两个细胞类型或两个治疗方法。

作者:迈克尔·夏皮罗(aut (cre)

维修工:迈克尔·夏皮罗<迈克尔。夏皮罗在crick.ac.uk >

从内部引用(R,回车引用(“deltaCaptureC”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“deltaCaptureC”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“deltaCaptureC”)

HTML R脚本 三角洲俘获
PDF 参考手册
文本 许可证

细节

biocViews BiologicalQuestion,软件,StatisticalMethod
版本 1.8.0
Bioconductor自 BioC 3.10 (r - 3.6)(2.5年)
许可证 麻省理工学院+文件许可证
取决于 R (> = 3.6)
进口 IRanges,GenomicRanges,SummarizedExperiment,ggplot2,DESeq2,发出滴答声
链接
建议 knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 deltaCaptureC_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 deltaCaptureC_1.8.0.zip
macOS 10.13(高山脉) deltaCaptureC_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/deltaCaptureC
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ deltaCaptureC
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/deltaCaptureC/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网