ddPCRclust

DOI:10.18129 / B9.bioc.ddPCRclust

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ddPCRclust。

ddPCR数据聚类算法

Bioconductor版本:3.14

ddPCRclust算法可以自动量化的非正交的cpd ddPCR反应与四位目标。为了确定正确的滴数为每个目标,是至关重要的正确识别所有集群和标签都基于自己的立场。更多信息可以分析哪些数据以及一个模板需要格式化,请检查装饰图案。

作者:Benedikt g .边缘(aut (cre),贾斯汀Meskas[所有],瑞安·r·边缘主义者(施)

维护人员:Benedikt g .边缘< bbrink在cebitec.uni-bielefeld.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ddPCRclust”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“ddPCRclust”)

PDF	R脚本	Bioconductor乳胶风格
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类,软件,ddPCR
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(4年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5)
进口	plotrix,线索平行,ggplot2,openxlsx,R.utils,flowCore,flowDensity(> = 1.13.3),SamSPECTRAL,flowPeaks
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/bgbrink/ddPCRclust
BugReports	https://github.com/bgbrink/ddPCRclust/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ddPCRclust_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	ddPCRclust_1.14.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	ddPCRclust_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ddPCRclust
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ddPCRclust
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ddPCRclust/
包下载报告	下载数据