dStruct

DOI:10.18129 / B9.bioc.dStruct

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅dStruct。

识别不同的活性区域从RNA structurome分析数据

Bioconductor版本:3.14

dStruct标识不同的活性区域从RNA structurome分析数据。dStruct兼容广泛的structurome分析技术,例如,SHAPE-MaP, DMS-MaPseq, Structure-Seq, SHAPE-Seq,等看到Choudhary et al,基因组生物学、2019潜在的方法。

作者:克里希纳。乔杜里(aut (cre)莎朗Aviran (aut)

维护人员:克里希纳Choudhary < kchoudhary ucdavis.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“dStruct”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“dStruct”)

HTML	R脚本	使用“dStruct”微分RNA structurome分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	测序,软件,StatisticalMethod,StructuralPrediction
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.14 (r - 4.1)(< 6个月)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 4.1)
进口	动物园,ggplot2,purrr,reshape2平行,IRanges,S4Vectors,rlang,统计grDevices跑龙套
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/dataMaster-Kris/dStruct
BugReports	https://github.com/dataMaster-Kris/dStruct/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	dStruct_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	dStruct_1.0.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	dStruct_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dStruct
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ dStruct
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/dStruct/
包下载报告	下载数据