cydar

DOI:10.18129 / B9.bioc.cydar

这个包是版本3.14的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见cydar

使用质量细胞术进行差异丰度分析

Bioconductor版本:3.14

在大量细胞计数数据中识别样品和组之间差异丰富的群体。提供了超球细胞计数、控制空间错误发现率和可视化高维标记空间中丰度变化的方法。

作者:Aaron Lun [aut, cre]

维护者:Aaron Lun

引用(来自R,输入引用(“cydar”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.1")并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("cydar")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“cydar”)

超文本标记语言 R脚本 探测差分丰度
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews FlowCytometryImmunoOncologyMultipleComparison蛋白质组学SingleCell软件
版本 1.18.0
在Bioconductor中 BioC 3.5 (R-3.4)(5年)
许可证 GPL-3
取决于 SingleCellExperiment
进口 冬青、方法、闪亮的、图形、统计、grDevices、utils、BiocGenericsS4VectorsBiocParallelSummarizedExperimentflowCoreBiobaseRcppBiocNeighbors
链接 Rcpp
建议 ncdfFlowtestthatrmarkdownknitr刨边机limmaglmnetBiocStyleflowStats
SystemRequirements c++ 11
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 cydar_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 cydar_1.18.0.zip(32- & 64位)
macOS 10.13 (High Sierra) cydar_1.18.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cydar
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cydar
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/cydar/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一:

  • 支持网站-有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表-用于包开发人员bob电竞体育官网