countsimQC

DOI:10.18129 / B9.bioc.countsimQC

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见countsimQC．

比较计数数据集的特征特征

Bioconductor版本:3.14

countsimQC提供了创建一个综合报告的功能，该报告比较了一组计数矩阵的广泛特征。一个重要的用例是将一个或多个合成计数矩阵与真实计数矩阵(可能是模拟的基础矩阵)进行比较。然而，任何计数矩阵集合都可以进行比较。

作者:Charlotte Soneson [aut, cre]

维护者:Charlotte Soneson

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“countsimQC”)

超文本标记语言	R脚本	countsimQC用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentalDesign，ImmunoOncology，微生物组，质量控制，RNASeq，ReportWriting，SingleCell，软件，可视化
版本	1.12.1
在Bioconductor	BioC 3.8 (R-3.5)(3.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (>= 3.5)
进口	rmarkdown(> = 2.5),刨边机，DESeq2(> = 1.16.0),dplyr，tidyr，ggplot2设备，工具，SummarizedExperiment，genefilter，DT，GenomeInfoDbData，caTools，randtests，统计，utils，方法
链接
建议	knitr，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/csoneson/countsimQC
BugReports	https://github.com/csoneson/countsimQC/issues
全靠我
进口我
建议我	马斯喀特
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	countsimQC_1.12.1.tar.gz
Windows二进制	countsimQC_1.12.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	countsimQC_1.12.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/countsimQC
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/countsimQC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/countsimQC/
软件包下载报告	下载数据