coseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.coseq

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅coseq。

Co-Expression测序数据的分析

Bioconductor版本:3.14

Co-expression表达谱由高通量测序数据的分析。特性(例如,基因)资料集中使用适应转换和混合模型或k - means算法和模型选择标准(选择适当数量的集群)。

作者:安德里亚•劳(cre, aut),凯西Maugis-Rabusseau[所有],安东尼Godichon-Baggioni(施)

维护人员:安德里亚劳<安德里亚。劳在inrae.fr >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“coseq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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HTML	R脚本	coseq
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.0.0),SummarizedExperiment,S4Vectors
进口	刨边机,DESeq2,capushe,Rmixmod,e1071,BiocParallel,ggplot2,尺度,HTSFilter,corrplot,HTSCluster、grDevices、图形、数据、方法、作文,mvtnorm
链接
建议	Biobase,knitr,rmarkdown,testthat,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	coseq_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	coseq_1.18.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	coseq_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/coseq
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ coseq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/coseq/
包下载报告	下载数据