cliProfiler

DOI:10.18129 / B9.bioc.cliProfiler

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅cliProfiler。

一个包夹数据可视化

Bioconductor版本:3.14

一种简单、快捷的方法来可视化和概要文件的高通量IP数据。这个包生成元基因概要文件和其他配置文件。这些资料可以提供有价值的信息对于理解IP实验结果。

作者:你周(aut (cre),凯瑟琳Zarnack (aut)

维护人员:你周< youzhoulearning gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cliProfiler”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cliProfiler”)

HTML	R脚本	cliProfiler小插曲
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq,表观遗传学,遗传学,测序,软件,可视化
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.14 (r - 4.1)(< 6个月)
许可证	艺术- 2.0
取决于	S4Vectors、方法、R (> = 4.1)
进口	dplyr,rtracklayer,GenomicRanges,ggplot2,BSgenome,Biostrings,跑龙套
链接
建议	knitr,rmarkdown,bookdown,testthat,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/Codezy99/cliProfiler
BugReports	https://github.com/Codezy99/cliProfiler/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	cliProfiler_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	cliProfiler_1.0.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	cliProfiler_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cliProfiler
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cliProfiler
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cliProfiler/
包下载报告	下载数据