cellity

DOI:10.18129 / B9.bioc.cellity

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅cellity

为单细胞RNA-seq数据质量控制

Bioconductor版本:3.14

支持向量机的方法来识别和过滤低质量细胞单细胞RNA-seq数据集。

作者:戴维斯托米斯拉夫•Illicic麦卡锡

维护人员:Tomislav Ilicic < ti243在cam.ac.uk >

从内部引用(R,回车引用(“cellity”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cellity”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

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文本 新闻

细节

biocViews DimensionReduction,GeneExpression,ImmunoOncology,归一化,预处理,质量控制,RNASeq,测序,软件,SupportVectorMachine,转录组,可视化
版本 1.22.0
Bioconductor自 BioC 3.3 (r - 3.3)(6年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 3.3)
进口 AnnotationDbi,e1071,ggplot2、图形grDevices、网格mvoutlier,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,robustbase统计数据,topGO,跑龙套
链接
建议 BiocStyle,脱字符号,knitr,testthat,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 cellity_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 cellity_1.22.0.zip
macOS 10.13(高山脉) cellity_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellity
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cellity
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/cellity/
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