celaref

DOI:10.18129 / B9.bioc.celaref

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅celaref。

单细胞RNAseq细胞集群通过引用标签

Bioconductor版本:3.14

单细胞RNAseq实验的聚类步骤之后,这个计划的目的是建议标签/细胞类型的集群,相似性的基础上,参考数据集。它需要读表数每细胞基因,和一系列的细胞属于每个集群,(用于测试和参考数据)。

作者:莎拉·威廉姆斯(aut (cre)

维护人员:莎拉·威廉姆斯<萨拉。在monash.edu williams1 >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“celaref”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“celaref”)

HTML	R脚本	手册
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	SingleCell,软件
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5.0),SummarizedExperiment
进口	桅杆,ggplot2,矩阵,dplyr,magrittr,统计,跑龙套,rlang,BiocGenerics,S4Vectors,readr,宠物猫,DelayedArray
链接
建议	limma平行,knitr,rmarkdown,ExperimentHub,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	celaref_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	celaref_1.12.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	celaref_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/celaref
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ celaref
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/celaref/
包下载报告	下载数据