cancerclass

DOI:10.18129 / B9.bioc.cancerclass

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅cancerclass。

从高维分子诊断测试的开发和验证数据

Bioconductor版本:3.14

分类协议开始和继续nearest-centroid分类特征选择步骤。预测的accurarcy可以使用训练集和测试集验证、评估分析交叉验证或多个随机验证协议。计算和可视化的方法连续预测分数允许平衡敏感性和特异性和定义一个截断值根据临床需求。

作者:Jan Budczies丹尼尔Kosztyla

维护人员:丹尼尔Kosztyla < danielkossi hotmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cancerclass”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cancerclass”)

PDF	R脚本	Cancerclass: R包从高维分子诊断测试的开发和验证数据
PDF		参考手册

细节

biocViews	癌症,分类,微阵列,软件,可视化
版本	1.38.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(9.5年)
许可证	GPL 3
取决于	R (> = 2.14.0),Biobase,binom、方法、统计数据
进口
链接
建议	cancerdata
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	cancerclass_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	cancerclass_1.38.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	cancerclass_1.38.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cancerclass
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cancerclass
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cancerclass/
包下载报告	下载数据