癌症
DOI:10.18129 / B9.bioc.canceR
这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅癌症。
一个图形用户界面来访问和建模MSKCC的癌症基因组学数据
Bioconductor版本:3.14
包的用户友好界面基于cgdsr和其他建模方案探讨,比较和分析所有可用的癌症数据(临床数据、基因突变、基因甲基化基因表达,蛋白质磷酸化,拷贝数改变)主办的计算生物学中心朗科特林纪念医院癌症中心(MSKCC)。
作者:卡里姆Mezhoud。核安全与安全部门。核科学中心的突尼斯。
维护人员:卡里姆Mezhoud < kmezhoud gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“癌症”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“癌症”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“癌症”)
| HTML | R脚本 | 癌症:图形用户界面来访问和建模MSKCC的癌症基因组学数据 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 聚类,去,GUI,GeneExpression,GeneSetEnrichment,KEGG,MultipleComparison,软件 |
| 版本 | 1.28.04 |
| Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(7年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 4.1), tcltk cgdsr |
| 进口 | GSEABase,tkrplot,geNetClassifier,RUnit,公式,rpart,生存,Biobase,phenoTest,circlize,plyr、图表、数据、grDevices跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | testthat(> = 3.1),knitr,rmarkdown,BiocStyle |
| SystemRequirements | Tktable, BWidget |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/kmezhoud/canceR/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | canceR_1.28.04.tar.gz |
| Windows二进制 | canceR_1.28.04.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | canceR_1.28.04.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/canceR |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/癌症 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/canceR/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
