咆哮
DOI:10.18129 / B9.bioc.bluster
这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅咆哮。
聚类算法Bioconductor
Bioconductor版本:3.14
包装一个容易扩展S4框架中常用的聚类算法。后端实现分层,k - means和图论聚类。几个实用程序还提供了比较和评价聚类结果。
作者:亚伦Lun (aut (cre),斯蒂芬妮·希克斯(施)
维护人员:亚伦Lun < infinite.monkeys.with。键盘在gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“咆哮”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“咆哮”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“咆哮”)
| HTML | R脚本 | 1。聚类算法 |
| HTML | R脚本 | 2。聚类诊断 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 聚类,GeneExpression,ImmunoOncology,SingleCell,软件,转录组 |
| 版本 | 1.4.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.12 (r - 4.0)(1.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | |
| 进口 | 属性、方法、效用,集群,矩阵,Rcpp,igraph,S4Vectors,BiocParallel,BiocNeighbors |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | knitr,rmarkdown,testthat,BiocStyle,dynamicTreeCut,scRNAseq,天窗,嘘,食物,pheatmap,冬青,mbkmeans,kohonen,apcluster |
| SystemRequirements | c++ 11 |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | OSCA。先进,OSCA。基本、OSCA.intro OSCA。multisample, OSCA.workflows |
| 进口我 | scDblFinder,食物 |
| 建议我 | 后面;,dittoSeq,mbkmeans,mumosa |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | bluster_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | bluster_1.4.0.zip(32位和64位) |
| macOS 10.13(高山脉) | bluster_1.4.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bluster |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/咆哮 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/bluster/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
