咆哮

DOI:10.18129 / B9.bioc.bluster

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅咆哮

聚类算法Bioconductor

Bioconductor版本:3.14

包装一个容易扩展S4框架中常用的聚类算法。后端实现分层,k - means和图论聚类。几个实用程序还提供了比较和评价聚类结果。

作者:亚伦Lun (aut (cre),斯蒂芬妮·希克斯(施)

维护人员:亚伦Lun < infinite.monkeys.with。键盘在gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“咆哮”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“咆哮”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“咆哮”)

HTML R脚本 1。聚类算法
HTML R脚本 2。聚类诊断
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 聚类,GeneExpression,ImmunoOncology,SingleCell,软件,转录组
版本 1.4.0
Bioconductor自 BioC 3.12 (r - 4.0)(1.5年)
许可证 GPL-3
取决于
进口 属性、方法、效用,集群,矩阵,Rcpp,igraph,S4Vectors,BiocParallel,BiocNeighbors
链接 Rcpp
建议 knitr,rmarkdown,testthat,BiocStyle,dynamicTreeCut,scRNAseq,天窗,,食物,pheatmap,冬青,mbkmeans,kohonen,apcluster
SystemRequirements c++ 11
增强了
URL
取决于我 OSCA。先进,OSCA。基本、OSCA.intro OSCA。multisample, OSCA.workflows
进口我 scDblFinder,食物
建议我 后面;,dittoSeq,mbkmeans,mumosa
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 bluster_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 bluster_1.4.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉) bluster_1.4.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bluster
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/咆哮
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/bluster/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网