这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅biscuiteer。
Bioconductor版本:3.14
bsseq加载的测试装具模块输出饼干,总结WGBS数据在可映射定义的区域和样本,有或没有非难,下降的mostly-NA行,年龄估计等。
作者:蒂姆•Triche Jr .) (aut (cre),扫读周(aut),本·约翰逊(aut),雅各布·莫里森(aut) Lyong Heo (aut)
维护人员:“雅各莫里森”<雅各。莫里森在vai.org >
从内部引用(R,回车引用(“biscuiteer”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“biscuiteer”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“biscuiteer”)
HTML | R脚本 | Biscuiteer用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DNAMethylation,DataImport,MethylSeq,软件 |
版本 | 1.8.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.10 (r - 3.6)(2.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 3.6),biscuiteerData,bsseq |
进口 | readr,qualV,矩阵,嫁祸于,HDF5Array,S4Vectors,Rsamtools,data.table,Biobase,GenomicRanges,BiocGenerics,VariantAnnotation,DelayedMatrixStats,SummarizedExperiment,GenomeInfoDb,Mus.musculus,Homo.sapiens,matrixStats,rtracklayer,QDNAseq,dmrseq、方法、跑龙套R.utils,gtools,BiocParallel |
链接 | |
建议 | DSS,covr,knitr,rmarkdown,减价,rlang,scmeth,pkgdown,roxygen2,testthat,QDNAseq.hg19,QDNAseq.mm10 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/trichelab/biscuiteer |
BugReports | https://github.com/trichelab/biscuiteer/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | biscuiteer_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | biscuiteer_1.8.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | biscuiteer_1.8.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biscuiteer |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ biscuiteer |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/biscuiteer/ |
包下载报告 | 下载数据 |