biodbHmdb

DOI:10.18129 / B9.bioc.biodbHmdb

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅biodbHmdb。

为连接到HMDB biodbHmdb、图书馆数据库

Bioconductor版本:3.14

biodb biodbHmdb图书馆是一个扩展的框架方案,提供访问HMDB代谢物数据库。它允许下载整个HMDB代谢物在本地数据库,访问条目和搜索条目的名称或描述。未来版本的这个包还将包括一个搜索质量和质谱注释。

作者:Pierrick罗杰(aut (cre)

维护人员:Pierrick罗杰< Pierrick。罗杰在cea.fr >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“biodbHmdb”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“biodbHmdb”)

HTML	R脚本	介绍biodbHmdb包。
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,基础设施,软件
版本	1.0.3
Bioconductor自	BioC 3.14 (r - 4.1)(< 6个月)
许可证	AGPL-3
取决于	R (> = 4.1)
进口	R6,biodb(> = 1.1.5),Rcpp
链接	Rcpp,testthat
建议	BiocStyle,roxygen2,devtools,testthat(> = 2.0.0),knitr,rmarkdown,covr,lgr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/pkrog/biodbHmdb
BugReports	https://github.com/pkrog/biodbHmdb/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	biodbHmdb_1.0.3.tar.gz
Windows二进制	biodbHmdb_1.0.3.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	biodbHmdb_1.0.3.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biodbHmdb
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ biodbHmdb
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/biodbHmdb/
包下载报告	下载数据