biobroom

DOI:10.18129 / B9.bioc.biobroom

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见biobroom

将Bioconductor对象转换成整齐的数据帧

Bioconductor版本:3.14

这个包包含转换生物信息学包构造的标准对象的方法,特别是那些在Bioconductor中的对象,并将它们转换为整齐的数据。因此,它是扫帚包的补充,并遵循相同的整理方法,增加,扫分。整理数据使得重组、重塑和可视化生物信息学分析变得容易。

作者:Andrew J. Bass, David G. Robinson, Steve Lianoglou, Emily Nelson, John D. Storey,由Laurent Gatto贡献

维护者:John D. Storey 和Andrew J. Bass

引文(从R内,输入引用(“biobroom”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“biobroom”)

超文本标记语言 R脚本 装饰图案的标题
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImportDifferentialExpressionGeneExpressionMultipleComparison蛋白质组学回归软件
版本 1.26.0
在Bioconductor BioC 3.2 (R-3.2)(6.5年)
许可证 LGPL
取决于 R (>= 3.0.0),扫帚
进口 dplyrtidyrBiobase
链接
建议 limmaDESeq2气道ggplot2plyrGenomicRangestestthatmagrittr刨边机qvalueknitrdata.tableMSnbasermarkdownSummarizedExperiment
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/StoreyLab/biobroom
BugReports https://github.com/StoreyLab/biobroom/issues
全靠我
进口我 泛太平洋伙伴关系
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 biobroom_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 biobroom_1.26.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) biobroom_1.26.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biobroom
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/biobroom
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/biobroom/
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Bioconductor

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网