自治

DOI:10.18129 / B9.bioc.autonomics

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见自治．

推广和直观跨平台组学分析

Bioconductor版本:3.14

该软件包为跨平台组学数据分析提供了通用和直观的解决方案。具有组学数据导入、预处理、挖掘、对比分析和可视化等功能。它遵循一种简洁的函数式编程范式。

作者:Aditya Bhagwat [aut, cre]， Shahina Hayat [aut]， Anna Halama [ctb]， Richard Cotton [ctb]， Laure Cougnaud [ctb]， Rudolf Engelke [ctb]， Hinrich Goehlmann [sad]， Karsten Suhre [sad]， Johannes Graumann [aut, sad, rth]

维护者:Aditya Bhagwat < Aditya。Bhagwat mpi-bn.mpg.de>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“自治”)

超文本标记语言	R脚本	using_autonomics
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,DimensionReduction,GeneExpression,MassSpectrometry,预处理,PrincipalComponent,RNASeq,软件,转录
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.0)
进口	abind,自信的,BiocFileCache,BiocGenerics,色彩,data.table,刨边机,ggplot2,ggrepel，图形，grDevices，网格，gridExtra,limma,magrittr,matrixStats、方法、MultiAssayExperiment平行,pcaMethods,rappdirs,rlang,R.utils,readxl,S4Vectors,尺度统计数据,stringi,SummarizedExperiment,tidyr，工具，utils
链接
建议	affy,AnnotationDbi,BiocManager,图,GenomicRanges,GEOquery,hgu95av2.db,ICSNP,knitr,lme4,lmerTest,质量,mixOmics,mpm,nlme,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,RCurl,遥控器,rmarkdown,ropls,Rsubread,rtracklayer,seqinr,statmod,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/bhagwataditya/autonomics
BugReports	https://bitbucket.org/graumannlabtools/autonomics
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	autonomics_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	autonomics_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	autonomics_1.2.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/autonomics
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/autonomics
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/autonomics/
软件包下载报告	下载数据