apeglm

DOI:10.18129 / B9.bioc.apeglm

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅apeglm。

全球语言监测机构系数近似后验估计

Bioconductor版本:3.14

apeglm提供了贝叶斯估计收缩效应大小不同的全球语言监测机构模型,使用后对个人的近似系数。

作者:Anqi朱(aut (cre),约书亚Zitovsky(施),迈克尔·约瑟夫·易卜拉欣(aut)爱(aut)

维修工:朱Anqi < anqizhu live.unc.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“apeglm”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“apeglm”)

HTML	R脚本	与apeglm效果评估
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯,DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于
进口	emdbook,SummarizedExperiment,GenomicRanges、方法、统计跑龙套,Rcpp
链接	Rcpp,RcppEigen,RcppNumerical
建议	DESeq2,气道,knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	rnaseqGene
进口我	airpart,debrowser,DiffBind,exomePeak2
建议我	bambu,BRGenomics,DESeq2,鱼池,NanoporeRNASeq
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	apeglm_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	apeglm_1.16.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	apeglm_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/apeglm
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ apeglm
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/apeglm/
包下载报告	下载数据