高山

DOI:10.18129 / B9.bioc.alpine

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见高山

高山

Bioconductor版本:3.14

RNA-seq转录本丰度估计的片段序列偏差建模和校正。

作者:Michael Love, Rafael Irizarry

维护者:Michael Love

引文(从R内,输入引用(“高山”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“高山”)

超文本标记语言 R脚本 高山
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews AlternativeSplicingBatchEffect报道DifferentialSplicingGeneExpression归一化质量控制RNASeq测序软件转录可视化
版本 1.20.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(5.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (>= 3.3)
进口 BiostringsIRangesGenomicRangesGenomicAlignmentsRsamtoolsSummarizedExperimentGenomicFeaturesspeedglm样条函数,RBGLstringr,统计,方法,图形,GenomeInfoDbS4Vectors
链接
建议 knitrtestthat减价alpineDatartracklayerensembldbBSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38RColorBrewer
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 alpine_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 alpine_1.20.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) alpine_1.20.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alpine
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/alpine
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/alpine/
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Bioconductor

R/凹口包和文档

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网