Ularcirc

DOI:10.18129 / B9.bioc.Ularcirc

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Ularcirc。

闪亮的应用规范和背部剪接分析(即循环和mRNA分析)

Bioconductor版本:3.14

Ularcirc读入恒星对齐接头连接文件和剪接分析提供了可视化和分析工具。用户可以评估backsplice连接和转发规范连接。

作者:大卫·汉弗莱斯(aut (cre)

维护人员:大卫·汉弗莱斯< d。汉弗莱斯在victorchang.edu.au >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“Ularcirc”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“Ularcirc”)

HTML	R脚本	Ularcirc
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	AlternativeSplicing,注释,报道,DataRepresentation,DifferentialSplicing,遗传学,测序,软件,可视化
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(3.5年)
许可证	文件许可证
取决于	R (> = 3.4.0)
进口	AnnotationHub,AnnotationDbi,BiocGenerics,Biostrings,BSgenome,data.table(> = 1.9.4),DT,GenomicFeatures,GenomeInfoDb,GenomeInfoDbData,GenomicAlignments,GenomicRanges,ggplot2,ggrepel,gsubfn,mirbase.db,时刻,Organism.dplyr,S4Vectors,闪亮的,shinydashboard,shinyFiles,shinyjs,寿司,yaml
链接
建议	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38,BiocStyle,httpuv,knitr,org.Hs.eg.db,rmarkdown,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Ularcirc_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	Ularcirc_1.12.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	Ularcirc_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Ularcirc
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Ularcirc
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Ularcirc/
包下载报告	下载数据