TurboNorm

DOI:10.18129 / B9.bioc.TurboNorm

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TurboNorm。

一个快速散点图平滑适合微阵列正常化

Bioconductor版本:3.14

快速散点图与二阶差分平滑基于b样点球。功能微阵列数据即单色正常化。Affymetrix / Illumina公司和双色数据提供marray MarrayRaw-objects或limma RGList-objects是可用的。

作者:范Iterson尚塔尔van Leeuwen

维护人员:范Iterson < mviterson gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TurboNorm”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“TurboNorm”)

PDF	R脚本	TurboNorm概述
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CpGIsland,DNAMethylation,MethylationArray,微阵列,归一化,OneChannel,预处理,软件,TwoChannel
版本	1.42.0
Bioconductor自	BioC 2.8 (r - 2.13)(11年)
许可证	LGPL
取决于	R (> = 2.12.0),转换,limma(> = 1.7.0),marray
进口	grDevices统计数据,affy,晶格
链接
建议	BiocStyle,affydata
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.humgen.nl/MicroarrayAnalysisGroup.html
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	TurboNorm_1.42.0.tar.gz
Windows二进制	TurboNorm_1.42.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	TurboNorm_1.42.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TurboNorm
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TurboNorm
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TurboNorm/
包下载报告	下载数据