TrajectoryUtils

DOI:10.18129 / B9.bioc.TrajectoryUtils

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TrajectoryUtils

单细胞轨迹分析工具

Bioconductor版本:3.14

实现底层工具为单细胞轨迹分析,主要用于内部重用高级包。包括一个函数创建一个集群级别最小生成树和数据结构来保存拟时间推理结果。

作者:亚伦Lun (aut (cre),凯利街(aut)

维护人员:亚伦Lun < infinite.monkeys.with。键盘在gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“TrajectoryUtils”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TrajectoryUtils”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“TrajectoryUtils”)

HTML R脚本 轨迹公用事业
PDF 参考手册

细节

biocViews GeneExpression,SingleCell,软件
版本 1.2.0
Bioconductor自 BioC 3.13 (r - 4.1)(1年)
许可证 GPL-3
取决于 SingleCellExperiment
进口 方法、统计数据矩阵,igraph,S4Vectors,SummarizedExperiment
链接
建议 BiocNeighbors,DelayedArray,DelayedMatrixStats,BiocParallel,testthat,knitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL //www.anjoumacpherson.com/packages/TrajectoryUtils
BugReports https://github.com/LTLA/TrajectoryUtils/issues
取决于我 弹弓,TSCAN
进口我 调味品,tradeSeq
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 TrajectoryUtils_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 TrajectoryUtils_1.2.0.zip
macOS 10.13(高山脉) TrajectoryUtils_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TrajectoryUtils
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TrajectoryUtils
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/TrajectoryUtils/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网