这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ToxicoGx。
Bioconductor版本:3.14
包含一组函数执行大规模toxicogenomic数据的分析,提供一个标准化的数据结构来保存信息相关注释,toxicogenomic数据的可视化和统计分析。
作者:Sisira Nair (aut),以斯帖Yoo (aut),克里斯托弗•伊尔斯(aut)艾米唐(aut) Nehme El-Hachem (aut),切赫斯米尔诺夫(aut),本杰明Haibe-Kains (aut (cre)
维护人员:本杰明Haibe-Kains < benjamin.haibe。实物地租在utoronto.ca >
从内部引用(R,回车引用(“ToxicoGx”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ToxicoGx”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ToxicoGx”)
HTML | R脚本 | ToxicoGx: R Toxicogenomics综合数据分析平台 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | GeneExpression,遗传药理学,药物基因组学,软件 |
版本 | 1.4.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.12 (r - 4.0)(1.5年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | R (> = 4.1),CoreGx |
进口 | SummarizedExperiment,S4Vectors,Biobase,BiocParallel,ggplot2,宠物猫,dplyr,caTools,下载器,magrittr、方法、reshape2,tidyr,data.table,为了,尺度、图形、grDevices平行,统计,跑龙套,limma,jsonlite |
链接 | |
建议 | rmarkdown,testthat,BiocStyle,knitr,tinytex,devtools,PharmacoGx,xtable,减价 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | ToxicoGx_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | ToxicoGx_1.4.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13(高山脉) | ToxicoGx_1.4.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ToxicoGx |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ToxicoGx |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ToxicoGx/ |
包下载报告 | 下载数据 |