一绺头发

DOI:10.18129 / B9.bioc.TRESS

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅一绺头发。

工具箱的mRNA表观遗传学测序分析

Bioconductor版本:3.14

这个包是致力于分析MeRIP-seq数据。目前的功能是检测transcriptome-wide m6A甲基化区域。该方法是基于分层负二项模型。

作者:振兴郭(aut (cre),吴皓(施)

维护人员:振兴郭<振兴。郭:emory.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“枝条”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“枝条”)

HTML	R脚本	卷发的用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	表观遗传学,PeakDetection,RNASeq,软件
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.14 (r - 4.1)(< 6个月)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R(> = 4.1.0),并行,S4Vectors
进口	跑龙套,rtracklayer,矩阵,matrixStats、数据、方法、图形GenomicRanges,GenomicFeatures,IRanges,Rsamtools,AnnotationDbi
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	TRESS_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	TRESS_1.0.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	TRESS_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TRESS
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/卷发
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TRESS/
包下载报告	下载数据