TFutils

DOI:10.18129 / B9.bioc.TFutils

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见TFutils

TFutils

Bioconductor版本:3.14

这个包帮助用户使用来自不同来源的TF元数据。提供了重要的tf目录及其分类。还提供了用于motif扫描的工具。

作者:Vincent Carey [aut, cre], Shweta Gopaulakrishnan [aut]

维护者:Vincent Carey

引文(从R内,输入引用(“TFutils”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“TFutils”)

超文本标记语言 R脚本 fimo16的注释
超文本标记语言 R脚本 TFutils——表示TFBS和TF目标集
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 软件转录组
版本 1.14.0
在Bioconductor BioC 3.7 (R-3.5)(4年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.1.0)
进口 方法,dplyrmagrittrminiUI闪亮的RsamtoolsGSEABaserjsonBiocFileCacheDThttrreadxlAnnotationDbiorg.Hs.eg.db,跑龙套
链接
建议 knitrdata.tabletestthatAnnotationFilterBiobaseGenomicFeaturesGenomicRangesGvizIRangesS4VectorsEnsDb.Hsapiens.v75BiocParallelBiocStyleGO.dbGenomicFilesGenomeInfoDbSummarizedExperimentUpSetRggplot2pnggwascatMotifDbmotifStackRColorBrewerrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 TFutils_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 TFutils_1.14.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) TFutils_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TFutils
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TFutils
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/TFutils/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网