SynExtend

DOI:10.18129 / B9.bioc.SynExtend

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SynExtend。

处理同线性对象的工具

Bioconductor版本:3.14

基因组序列之间共享秩序提供了大量的信息。同线性对象由R包解密提供定量信息,共享秩序。从同线性对象SynExtend提供工具来提取信息。

作者:尼古拉斯·厄尔(aut (cre)Adelle费尔南多(施),埃里克·赖特(aut)

维修工:尼古拉斯·厄尔在pitt.edu < npc19 >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SynExtend”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SynExtend”)

PDF	R脚本	UsingSynExtend
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类,ComparativeGenomics,DataImport,遗传学,软件
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.1.0),解读(> = 2.20.0)
进口	方法,Biostrings,S4Vectors,IRanges跑龙套,统计数据
链接
建议	BiocStyle,knitr,rtracklayer,igraph,减价,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SynExtend_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	SynExtend_1.6.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	SynExtend_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SynExtend
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SynExtend
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SynExtend/
包下载报告	下载数据