分裂
DOI:10.18129 / B9.bioc.SPLINTER
这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅分裂。
拼接的成绩单翻译
Bioconductor版本:3.14
提供工具来分析可变剪接网站,解释结果序列信息的基础上,选择并设计引物网站validiation,给下游事件的可视化表示指导实验。
作者:戴安娜低(aut (cre)
维护人员:戴安娜低< lowdiana gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“分裂”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“分裂”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“分裂”)
| R脚本 | 分裂 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | AlternativeSplicing,GeneExpression,ImmunoOncology,RNASeq,软件,可视化 |
| 版本 | 1.20.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(5.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 3.6.0), grDevices,统计数据 |
| 进口 | 图形,ggplot2,seqLogo,Biostrings,biomaRt,GenomicAlignments,GenomicRanges,GenomicFeatures,Gviz,IRanges,S4Vectors,GenomeInfoDb跑龙套,plyr,stringr、方法、BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9,googleVis |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/dianalow/SPLINTER/ |
| BugReports | https://github.com/dianalow/SPLINTER/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | SPLINTER_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SPLINTER_1.20.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | SPLINTER_1.20.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SPLINTER |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/分裂 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SPLINTER/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
