分裂

DOI:10.18129 / B9.bioc.SPLINTER

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅分裂

拼接的成绩单翻译

Bioconductor版本:3.14

提供工具来分析可变剪接网站,解释结果序列信息的基础上,选择并设计引物网站validiation,给下游事件的可视化表示指导实验。

作者:戴安娜低(aut (cre)

维护人员:戴安娜低< lowdiana gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“分裂”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“分裂”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“分裂”)

PDF R脚本 分裂
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews AlternativeSplicing,GeneExpression,ImmunoOncology,RNASeq,软件,可视化
版本 1.20.0
Bioconductor自 BioC 3.4 (r - 3.3)(5.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = 3.6.0), grDevices,统计数据
进口 图形,ggplot2,seqLogo,Biostrings,biomaRt,GenomicAlignments,GenomicRanges,GenomicFeatures,Gviz,IRanges,S4Vectors,GenomeInfoDb跑龙套,plyr,stringr、方法、BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9,googleVis
链接
建议 BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/dianalow/SPLINTER/
BugReports https://github.com/dianalow/SPLINTER/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 SPLINTER_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 SPLINTER_1.20.0.zip
macOS 10.13(高山脉) SPLINTER_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SPLINTER
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/分裂
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SPLINTER/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网