SEtools

DOI:10.18129 / B9.bioc.SEtools

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见SEtools．

SEtools:用于总结实验的工具

Bioconductor版本:3.14

这包括一组使用summarizeexperiment类的工具，包括合并、融化、聚合和绘图函数。特别是，SEtools为绘制SE对象的复杂热图提供了一个简单的界面。

作者:Pierre-Luc Germain [cre, aut]

维护者:Pierre-Luc Germain < Pierre-Luc。日耳曼在hest.ethz.ch>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“SEtools”)

超文本标记语言	R脚本	SEtools
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，软件，可视化
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(2.5年)
许可证	GPL
取决于	R (>= 4.0)
进口	S4Vectors，SummarizedExperiment，data.table，系列化，ComplexHeatmap，circlize、方法、BiocParallel，randomcoloR，刨边机，openxlsx，股东价值分析统计数据,DESeq2，矩阵、网格
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，ggplot2，pheatmap
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/plger/SEtools
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	SEtools_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	SEtools_1.8.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	SEtools_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SEtools
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SEtools
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SEtools/
软件包下载报告	下载数据