此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见SCnorm.
Bioconductor版本:3.14
这个包实现了SCnorm——一种规范化单细胞RNA-seq数据的方法。
作者:朗达·巴彻
维护者:Rhonda Bacher
引文(从R内,输入引用(“SCnorm”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“SCnorm”)
R脚本 | SCnorm装饰图案 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ImmunoOncology,归一化,RNASeq,SingleCell,软件 |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(4.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 3.4.0) |
进口 | SingleCellExperiment,SummarizedExperiment,统计,方法,图形,grDevices,并行,quantreg,集群,时刻,data.table,BiocParallel,S4Vectors,ggplot2,forcats,BiocGenerics |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,devtools |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/rhondabacher/SCnorm |
BugReports | https://github.com/rhondabacher/SCnorm/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | SCnorm_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | SCnorm_1.16.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | SCnorm_1.16.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SCnorm |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SCnorm |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SCnorm/ |
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