SCnorm

DOI:10.18129 / B9.bioc.SCnorm

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见SCnorm

单细胞RNA-seq数据的规范化

Bioconductor版本:3.14

这个包实现了SCnorm——一种规范化单细胞RNA-seq数据的方法。

作者:朗达·巴彻

维护者:Rhonda Bacher

引文(从R内,输入引用(“SCnorm”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“SCnorm”)

PDF R脚本 SCnorm装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ImmunoOncology归一化RNASeqSingleCell软件
版本 1.16.0
在Bioconductor BioC 3.6 (R-3.4)(4.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 3.4.0)
进口 SingleCellExperimentSummarizedExperiment,统计,方法,图形,grDevices,并行,quantreg集群时刻data.tableBiocParallelS4Vectorsggplot2forcatsBiocGenerics
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdowndevtools
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/rhondabacher/SCnorm
BugReports https://github.com/rhondabacher/SCnorm/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 SCnorm_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 SCnorm_1.16.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) SCnorm_1.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SCnorm
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SCnorm
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SCnorm/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网