短链脂肪酸

DOI:10.18129 / B9.bioc.SCFA

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅短链脂肪酸。

因子分析SCFA:子类型化通过共识

Bioconductor版本:3.14

子类型化通过共识因子分析(SCFA)可以有效地去除噪声信号分子模式multi-omics数据一致。SCFA首先使用一个autoencoder只选择重要的特性,然后反复进行因子分析来表示数据和不同数量的因素。使用这些表示,它能够可靠地识别癌症亚型和准确地预测风险评分的患者。

作者:Duc Tran (aut (cre),挂着阮(aut),锡阮(曾经)

维护人员:Duc Tran在nevada.unr.edu <道>

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SCFA”)

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文档

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browseVignettes (“SCFA”)

HTML	R脚本	SCFA包手册
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类,聚类,软件,生存
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(1.5年)
许可证	LGPL
取决于	R (> = 4.0)
进口	matrixStats,keras,tensorflow,BiocParallel,igraph,矩阵,集群,clusterCrit,心理,glmnet,RhpcBLASctl统计,跑龙套、方法生存
链接
建议	knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/duct317/SCFA
BugReports	https://github.com/duct317/SCFA/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SCFA_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	SCFA_1.4.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	SCFA_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SCFA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SCFA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SCFA/
包下载报告	下载数据