RpsiXML

DOI:10.18129 / B9.bioc.RpsiXML

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见RpsiXML．

R接口到PSI-MI 2.5文件

Bioconductor版本:3.14

查询、数据结构和交互数据集可视化的接口。这个包实现了PSI-MI 2.5标准，目前支持8个数据库。支持PSI-MI 2.5标准的数据库将不断增加。

作者:张季涛[aut, cre, ctb]、斯蒂芬·维曼[ctb]、马克·卡尔森[ctb]、蒋东辉[ctb]

维护者:Jitao David Zhang

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“RpsiXML”)

PDF	R脚本	RpsiXML包的应用实例
PDF	R脚本	读取PSI-25 XML文件
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施，蛋白质组学，软件
版本	2.36.0
在Bioconductor	BioC 2.3 (R-2.8)(13.5年)
许可证	LGPL-3
取决于	方法,XML(>= 2.4.0)， utils
进口	注释(> = 1.21.0),图(> = 1.21.0),Biobase，RBGL(> = 1.17.0),超图(> = 1.15.2),AnnotationDbi
链接
建议	org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，org.Dm.eg.db，org.Rn.eg.db，org.Sc.sgd.db，Rgraphviz，ppiStats，ScISI，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com
全靠我	ScISI
进口我	ScISI
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	RpsiXML_2.36.0.tar.gz
Windows二进制	RpsiXML_2.36.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	RpsiXML_2.36.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RpsiXML
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RpsiXML
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RpsiXML/
软件包下载报告	下载数据