ReQON

DOI:10.18129 / B9.bioc.ReQON

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ReQON。

调整质量的核苷酸

Bioconductor版本:3.14

算法调整的基质量分数在BAM测序数据格式保持一致。

作者:克里斯托弗·Cabanski Keary Cavin,克里斯Bizon

维护人员:克里斯托弗Cabanski < cabanskc gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ReQON”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ReQON”)

PDF	R脚本	ReQON教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	HighThroughputSequencing,预处理,质量控制,测序,软件
版本	1.40.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(10.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.0.2),Rsamtools,seqbias
进口	rJava、图表、数据、grDevices跑龙套
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements	Java版本> = 1.6
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ReQON_1.40.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)	ReQON_1.40.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ReQON
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ReQON
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ReQON/
包下载报告	下载数据