Rbowtie

DOI:10.18129 / B9.bioc.Rbowtie

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见Rbowtie．

领结包装

Bioconductor版本:3.14

这个包提供了一个围绕流行的领结短读对齐器和SpliceMap的R包装器，SpliceMap是一个全新的拼接结发现和对齐工具。该包由类星体生物导体包使用。我们建议使用类星体包，而不是直接使用Rbowtie。

作者:Florian Hahne, Anita Lerch, Michael B Stadler

维护者:Michael Stadler < Michael。斯塔德勒在fmi.ch>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“Rbowtie”)

超文本标记语言	R脚本	Rbowtie的介绍
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	对齐，测序，软件
版本	1.34.0
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(9年)
许可证	artist -2.0 |文件许可证
取决于
进口
链接
建议	testthat平行,BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL	https://github.com/fmicompbio/Rbowtie
BugReports	https://github.com/fmicompbio/Rbowtie/issues
全靠我	QuasR
进口我	MACPET，multicrispr
建议我	eisaR
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	Rbowtie_1.34.0.tar.gz
Windows二进制	Rbowtie_1.34.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	Rbowtie_1.34.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rbowtie
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Rbowtie
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Rbowtie/
软件包下载报告	下载数据