Rbowtie

DOI:10.18129 / B9.bioc.Rbowtie

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见Rbowtie

领结包装

Bioconductor版本:3.14

这个包提供了一个围绕流行的领结短读对齐器和SpliceMap的R包装器,SpliceMap是一个全新的拼接结发现和对齐工具。该包由类星体生物导体包使用。我们建议使用类星体包,而不是直接使用Rbowtie。

作者:Florian Hahne, Anita Lerch, Michael B Stadler

维护者:Michael Stadler < Michael。斯塔德勒在fmi.ch>

引文(从R内,输入引用(“Rbowtie”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“Rbowtie”)

超文本标记语言 R脚本 Rbowtie的介绍
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 对齐测序软件
版本 1.34.0
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(9年)
许可证 artist -2.0 |文件许可证
取决于
进口
链接
建议 testthat平行,BiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements GNU使
增强了
URL https://github.com/fmicompbio/Rbowtie
BugReports https://github.com/fmicompbio/Rbowtie/issues
全靠我 QuasR
进口我 MACPETmulticrispr
建议我 eisaR
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 Rbowtie_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 Rbowtie_1.34.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) Rbowtie_1.34.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rbowtie
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Rbowtie
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Rbowtie/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网