RNAmodR.RiboMethSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAmodR.RiboMethSeq

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RNAmodR.RiboMethSeq。

检测由RiboMethSeq 2 ' - o甲基化

Bioconductor版本:3.14

RNAmodR.RiboMethSeqimplements the detection of 2'-O methylations on RNA from experimental data generated with the RiboMethSeq protocol. The package builds on the core functionality of the RNAmodR package to detect specific patterns of the modifications in high throughput sequencing data.

作者:Felix通用恩斯特(aut (cre),丹尼斯·l·j·拉方丹则施,曾经

维修工:Felix通用恩斯特< felix.gm。恩斯特在outlook.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RNAmodR.RiboMethSeq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“RNAmodR.RiboMethSeq”)

HTML	R脚本	RNAmodR.RiboMethSeq
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	测序,软件,可视化,WorkflowStep
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.0),RNAmodR(> = 1.5.3)更正
进口	方法,S4Vectors,BiocGenerics,IRanges,GenomicRanges,Gviz
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,rtracklayer,RNAmodR.Data
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/FelixErnst/RNAmodR.RiboMethSeq
BugReports	https://github.com/FelixErnst/RNAmodR.RiboMethSeq/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	RNAmodR.RiboMethSeq_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	RNAmodR.RiboMethSeq_1.8.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	RNAmodR.RiboMethSeq_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAmodR.RiboMethSeq
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RNAmodR.RiboMethSeq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RNAmodR.RiboMethSeq/
包下载报告	下载数据