RCM

DOI:10.18129 / B9.bioc.RCM

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见RCM．

用负二项分布拟合微生物组的行-列关联模型

Bioconductor版本:3.14

结合列联表的对数线性分析、灵活响应函数估计和经验贝叶斯离散估计的思想，用于微生物组数据集的探索性可视化。该软件包包括无约束分析和有约束分析。

作者:Stijn Hawinkel < Stijn。Hawinkel在ugent, be>

维护者:Joris Meys < Joris。Meys at ugent.be>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes (RCM)

超文本标记语言	R脚本	RCM包的手册
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DimensionReduction，宏基因组，微生物组，软件，可视化
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(3年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.6.0)
进口	RColorBrewer，阿拉巴马州，刨边机，reshape2，tseries，VGAM，ggplot2(> = 2.2.1.9000),nleqslv，phyloseq，张量，质量，统计，grDevices，图形，方法
链接
建议	knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/vignettes/RCM/inst/doc/RCMvignette.html/
BugReports	https://github.com/CenterForStatistics-UGent/RCM/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	RCM_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	RCM_1.10.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	RCM_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RCM
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RCM
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RCM/
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