R3CPET

DOI:10.18129 / B9.bioc.R3CPET

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅R3CPET

3 cpet:找到辅助因子复合物在Chia-PET实验中使用分层狄利克雷的过程

Bioconductor版本:3.14

包提供了一组方法来推断的蛋白质更可能共同维护chormatin交互ChIA-PET实验结果。

作者:杨Djekidel MN, Chen等人。

维护人员:穆罕默德Nadhir Djekidel < djek。nad gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“R3CPET”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“R3CPET”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“R3CPET”)

PDF R脚本 3 cpet:找到辅助因子复合物保持Chia-PET交互
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 贝叶斯,GeneExpression,GenePrediction,GraphAndNetwork,,网络,NetworkInference,软件
版本 1.26.0
Bioconductor自 BioC 3.1 (r - 3.2)(7年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 3.2),Rcpp(> = 0.10.4)方法
进口 方法、并行ggplot2,pheatmap,clValid,igraph,data.table,reshape2,Hmisc,RCurl,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges(> = 2.13.12),GenomeInfoDb,GenomicRanges(> = 1.31.8),ggbio
链接 Rcpp
建议 BiocStyle,knitr,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,biovizBase,biomaRt,AnnotationDbi,org.Hs.eg.db,闪亮的,ChIPpeakAnno
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/sirusb/R3CPET/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 R3CPET_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 R3CPET_1.26.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉) R3CPET_1.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/R3CPET
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ R3CPET
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/R3CPET/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网