王子
DOI:10.18129 / B9.bioc.PrInCE
这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅王子。
预测从Co-Elution Interactomes
Bioconductor版本:3.14
王子(从Co-Elution预测Interactomes)使用朴素贝叶斯分类器训练dataset-derived功能恢复蛋白质-蛋白质之间的关系从Co-Elution色谱配置文件。这个包包含的R实现王子。
作者:迈克尔Skinnider (aut, trl cre), r·格雷格•斯泰西[所有]Nichollas斯科特(施),安德斯Kristensen[所有],伦纳德·福斯特(aut,)
维护人员:迈克尔Skinnider <迈克尔。在msl.ubc.ca skinnider >
从内部引用(R,回车引用(“王子”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“王子”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“王子”)
| HTML | R脚本 | 与王子从co-elution Interactome重建数据 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | NetworkInference,蛋白质组学,软件,SystemsBiology |
| 版本 | 1.10.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.9 (r - 3.6)(3年) |
| 许可证 | GPL-3 +文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 3.6.0) |
| 进口 | purrr(> = 0.2.4),dplyr(> = 0.7.4),tidyr(> = 0.8.99),预测(> = 8.2),进步(> = 1.1.2),Hmisc(> = 4.0),naivebayes(> = 0.9.1),robustbase(0.92 > = 7),管理员(> = 0.8.0),LiblineaR(> = 2.10 8),speedglm(> = 0.3 - 2),测试人员(> = 0.1.7),magrittr(> = 1.5),Biobase(> = 2.40.0),MSnbase跑龙套,(> = 2.8.3),统计方法,Rdpack(> = 0.7) |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/fosterlab/PrInCE/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | PrInCE_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | PrInCE_1.10.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | PrInCE_1.10.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PrInCE |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/王子 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/PrInCE/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
